ComicFlash、ComicFlashWIDEの各フォルダには、以下のようなファイル・フォルダが入っています：
| index.html | ... 目次ページ |
|---|---|
| comicflash.swf | ... ComicFlash本体 |
| load_cf.js | ... 表示用JavaScriptファイル |
| subwin.js | ... サブウィンドウ表示用JavaScriptファイル |
| content/ | ... コンテンツフォルダ |
| ┣ comicflash.html | ... 表示用HTMLファイル |
| ┣ image/ | ... 画像部品フォルダ |
| ┣ pages/ | ... ページ画像フォルダ |
| ┣ pages_large/ | ... 拡大画像フォルダ |
| ┗ pref.xml | ... 設定ファイル |